制止地铁性骚扰是专用车厢的主要目的，并广受支持
近十几年来，在东京都，警视厅生活安全部有对每年电车内猥亵案件数量统计，2000年共有1854件。在2001年，不论车厢内外，在地铁中违反《迷惑防止条例违反送致状況》的案件有2,057件。2004年东京都被举报的威胁或偷拍案件月2206件，是1996年的3倍，其中半数受害者都是未成年女性。实际发生的骚扰事件要比官方的统计数字多得多。“许多受害者不愿意报警，因为她们觉得难为情，”一位警方发言人告诉读卖新闻。“我们要集中精力解决那些性质最恶劣的案件。” 日本地铁中的猥亵行为越来越多，逐渐成为一种社会问题，并被广泛认为是一种犯罪行为。在这种背景下，为了让女性能够安心乘车，在地铁车辆中重新引入女性专用车厢又被重新考虑。与此同时，由于输送力增强计划都导致的运力上升、经济衰退和少子化导致的乘车人数下降，使得地铁的整体拥挤程度下降，为女性车厢重新出现提供了客观上的实行可能。 2004年公明党的调查显示，六成20、30多岁的女性曾遭到过地铁性骚扰。2005年，某民间团体的调查结果是，九成女性和六成男性，合计78%的受访者赞同女性专用车厢。不过也有例外，2006年札幌市交通局的类似调查中，65%的男性、35%的女性，总计56%的被调查者表示反对。2009年5月产经新闻社进行了关于女性车厢是否有用的调查，三分之二的人认为是有用的。
女性车厢并无法律层面上的强制，只是各公司行为
对于这种铁道公司的这类规定，日本国土交通省认为，这种制度需要在男性乘客的理解下完成，并非排斥男性，也没有直接禁止男性乘车的法律依据。大阪市交通局、横滨市交通局、札幌市交通局也并不给予这种制度以强制力保证。在有些地方运营的女性车厢中，男孩和残疾人也可以进入。 同时，《铁道营业法》原本有“男性进入女性或儿童专用候车室可处以80日元以下罚款”的规定，但国土交通省认为，这条法律不适用于现行的女性车厢制度。名古屋市还转门写了报告《名古屋市交通局铁道营业法34条2号适用讨论》陈述这一点。
不过女性车厢也带来了额外的拥挤问题
在产经新闻的调查中，也有六成受访者认为，女性专用车厢确实令人有性别疏离感，并确实感觉到了不便。例如，在相模铁道，女性车厢被设置在整个列车的中部，并禁止男性进入，如果男性需要向其他车厢移动，有时会不得不在停站时从车外“迂回”。而一些设在列车尾部的女性车厢也带来了女性进出站台的不便。 更大的麻烦是，由于女性车厢不允许男性入内，常常出现女性车厢比较空而普通车厢却拥挤不堪的状况。还有心理学家通过日本人在拥挤地段行走的实验结果指出，男女混合人群的人员密度高于单性人群，说明进行性别分隔后，车厢利用率也降低了。国土交通省就针对这一问题进行了关于女性车厢可实行区域和时间的讨论，东急东横线就在引入女性车厢之后，由于拥挤加剧而缩小了女性车厢的数量和缩短了有效时间。2006年，小田急电铁则在车内做了一段时间的拥挤程度调研，分析了个节车厢的拥挤程度，最后将女性车厢定在最不拥挤的前部车厢。